Fachgruppe Mikrobiologie und Biofilme
Mikroorganismen wie Bakterien, Einzeller und verschiedene Algen und Pilze können sich auf praktisch allen Oberflächen etablieren und dünne strukturierte Lebensräume = Biofilme bilden. Geschützt durch eine Matrix aus gelartigem Schleim, bestehend aus extrazellulären Polymeren, können die im Biofilm lebenden Organismen vielfältige, leistungsfähige und widerstandsfähige Lebensgemeinschaften bilden.
Wir beschäftigen uns vorwiegend mit mikrobiellen Biofilmen, welche auf verschiedensten natürlichen und technischen Oberflächen ernsthafte Probleme verursachen können. Infektionen im Körper, auf Implantaten und in medizinischen Geräten, Zerstörung von Baumaterialien, Werkstoffen und Maschinen, Korrosion und Verstopfen von Leitungssystemen oder Reduktion des Wärmetransfers in Wärmetauschern sind nur einige Beispiele.
Die Bekämpfung pathogener Mikroorganismen und Biofilmen ist eine zusätzliche Herausforderung, insbesondere im Umfeld zunehmender Resistenzen.
Kompetenzen
In Zusammenarbeit mit unseren Industrie- und Projektpartner entwickeln und überprüfen wir fallspezifische Lösungen wie bestehende Biofilme bekämpft und deren Bildung kontrolliert und reduziert werden kann.
Mit Hilfe vorhandener Testsystemen oder kundenspezifischen Modifikationen oder Entwicklungen können wir die Biofilmbildung beobachten und analysieren.
- Kultivation von Biofilmen auf verschiedenen Oberflächen
- Untersuchen und Überprüfen von Massnahmen gegen die Biofilmbildung in diversen wasserführenden technischen Systemen und auf verschiedenen medizinaltechnischen Oberflächen
- Überprüfen von Keimreduktionsstrategien
Die Analyse von Biofilmen erfolgt mittels klassischer Methoden aus der Mikrobiologie, Biochemie und Chemie, wie:
- Anreicherung, Isolation, Kultivation und Charakterisierung von Mikroorganismen
- Quantifizieren von Bakterien mittels verschiedener Methoden (klassisch oder mittels Flow Cytometry)
- Identifikation von Bakterien mittels Massenspektroskopie (Maldi-TOF)
- Phänotypische Charakterisierung mittels Omnilog
- Licht- und Fluoreszenzmikroskopie (konfokale Laser Scanning Mikroskopie und Rasterelektronenmikroskopie in Zusammenarbeit mit anderen Fachstellen)
Weitere Kompetenzen in der Mikrobiologie sind:
- Qualitative und quantitative Untersuchungen von Luftkeimen (Bioaerosole) und Wasserkeimen
- Mobilisierung von Metallen durch Mikroorganismen (Bioleaching/Biomining)
- Überprüfen von Keimreduktionsstrategien
- Durchführen von Suszeptibilitätstest mit Bakterien und Pilzen (AST)
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Studium
Verantwortlich im:
Für die Kurse Biologie, Mikrobiologie und Biochemie 3 (CH) und für das mikrobiologische Praktikum.
Für den Kurs Biofilme.
Folgende Themen wurden oder können in Bachelor- und Masterarbeiten werden:
Team
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Studierende (Bachelor- und Masterarbeiten 2022)
- Timo Fankhauser (BSc)
- Julia Ammann (MSc)
- Nada Gad (MSc)